ForInter
BAYERISCHER FORSCHUNGSVERBUND INTERAKTION HUMANER GEHIRNZELLEN
Der Verbund
Im menschlichen Gehirn sind unterschiedliche, spezialisierte Zellpopulationen, wie Neuronen und Gliazellen in einem komplexen Bauplan angeordnet. Die verschiedenen Zellen bilden funktionelle und dynamische Netzwerke und ihr Zusammenspiel ist für die unterschiedlichen Funktionen des Gehirns von grundlegender Bedeutung.
Viele Fragen zur Rolle der unterschiedlichen Zellen für die Funktionen des Gehirns sowohl in Gesundheit als auch bei Krankheiten sind bis heute ungeklärt. Für eine strukturelle Untersuchung des Gehirns steht post mortem Gewebe zur Verfügung. Die neuroanatomische bzw. -pathologische Untersuchung bildet aber nur einen definierten Zeitpunkt des Krankheitsgeschehens und Lebens statisch ab. Für ein besseres Verständnis der physiologischen und pathologischen Funktion sind dynamische und/ oder funktionelle Untersuchungen des Zusammenspiels der unterschiedlichen humanen Gehirnzellen notwendig.
So hat der Bayerische Forschungsverbund ForInter (Forschungsverbund Interaktion humaner Gehirnzellen) zum Ziel die Interaktion verschiedener Zelltypen des menschlichen Gehirns in multidimensionalen Zellkultursystemen zu untersuchen. Die Arbeitshypothese lautet:
Definierte humane Zell-Zell Systeme sind in der Lage physiologische und pathologische Interaktionen des menschlichen Gehirns zu modellieren
Die Entwicklungen der Biologie und Stammzellforschung der letzten Jahre haben die Voraussetzungen für die Generierung multidimensionaler Zellkultursysteme und zerebraler Organoide (Mini Brains) geschaffen, welche neuartige Einblicke in strukturelle und dynamische Interaktionen versprechen. Als Modell ermöglichen diese die Untersuchung sowohl der normalen humanen Physiologie der Gehirnentwicklung als auch pathogener Prozesse.
ForInter vereint Wissenschaftler/-innen der Neurobiologie, mit Expertise in grundlagenbiologischen und stammzellbiologischen Fragestellungen, sowie Wissenschaftler/-innen aus der Neuropathologie und der Translation in der Neurologie. Die neurobiologische Expertise wird interdisziplinär ergänzt und verstärkt durch Wissenschaftler/-innen der Bioinformatik und dem Gebiet von Ethik und Recht.
Im Verbund stehen für die Arbeit in den Projekten neueste methodische Werkzeuge zur Verfügung.
So ermöglichen Plattformen wie
• die Generierung spezifischer Zelltypen und neuraler Organoide
• die Ko-kultivierung von unterschiedlichen Zelltypen des Nervensystems in 2D oder 3 D Strukturen
und methodische Werkzeuge wie
• die Einzelzell RNA seq Analyse
• die Veränderung von einzelnen Genen/Genabschnitten (Genomeditierung) mittels der Genschere CRISPR/CAS9
• bioinformative Datenanalyse
neue Ansätze in der Erforschung der Entwicklung des Gehirns, der physiologischen Funktion und auch der Entstehung von Krankheiten.
Das primäre Ziel des Forschungsverbundes ForInter ist die Analyse der Zell-Zell-Interaktionen von humanen neuralen Zellen. Hierbei sollen folgende aus IPSZ differenzierte Zelltypen zum Einsatz kommen: Neurone (mit unterschiedlichen Neurotransmitterphänotypen), Oligodendrozyten, Astrozyten, Mikroglia, Perizyten.
Organisation
Geschäftsführung
Wissenschaftler/in
Sprecherin
Partner im Verbund
Wissenschaftliche Partner
- Friedrich-Alexander-Universität Erlangen
- Universität Regensburg
- Technische Universität München
- Universität Passau
- ETH Zürich
- Department für Biosysteme (D-BSSE)
Arbeitsfelder
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Zentralprojekt und Schwerpunktsgruppen zu verbundübergreifenden Forschungsaspekten
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Interaktion von neuralen Zellen in der Entwicklung und unter physiologischen Bedingungen
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Interaktion von neuralen Zellen unter pathologischen Bedingungen
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Bioinformatische Methoden in der Analyse und Modellierung der Interaktion von neuralen Zellen
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Ethik- und Rechtsfragen in der Forschung mit genomeditierten Stammzellen und Gehirn-Organoiden und den Implikationen der therapeutischen Anwendung
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Projekte
- Forschungskooperationspartner
- Identifizierung transkriptioneller Netzwerke in der Entwicklung interhemisphärischer Nervenzellverbindungen
- Neuron-Mikroglia Interaktion: physiologische und pathologische Signaturen
- Computergestützte Identifikation von Liganden-Rezeptor Interaktionen in Einzelzell-Transkriptom-Daten und Anwendung auf Neuron- Mikroglia Wechselwirkung
- Zentralprojekt
- Neuron-Oligodendrozyt Interaktion: gliale Pathologie bei der Neurodegeneration
- Untersuchung der funktionalen Heterogenität von humanen Perizyten und ihrer zellulären Interaktionen mittels 2D Zellkulturmodellen und 3D Organoid Systemen
- Rechtliche und ethische Fragen der Forschung mit aus genomeditierten IPSZ generierten Gehirnzellen und ihrer Anwendung
- 3D humane Zellkultursysteme zur Untersuchung von Gliomen
- Die Rolle von Oligodendrozyten bei Entwicklungsstörungen des Gehirns und resultierenden Erkrankungen
Aktuelles
Pressemitteilungen
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14.10.2021
Pressemitteilung "Gehirnorganoide und Science Lates Event"
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08.10.2021
Pressemitteilung ForInter zum Start des Hi!A - Festival für Kunst & Forschung in Bayern
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09.09.2020
Prof. Beate Winner, Prof. Hans-Georg Dederer and Prof. Barbara Treutlein - Projektleiter und Kooperationspartner von ForInter im GSCN White Paper über Organoide
Projektleiter und Kooperationspartner von ForInter werden im diesjährigen GSCN White Paper im Zusammenhang mit der Organoid-Forschung erwähnt. Das Paper mit dem Titel "Organoide - von der Stammzelle zur zukunftsweisenden Technologie", das den Stand der Forschung, Kernaussagen und politische Handlungsempfehlungen zur Organoidtechnologie nennt, erschien November 2020 durch das German Stem Cell Network (GSCN).
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12.05.2020
Artikel über die Rechte von Gehirn-Organoiden
Die Erforschung und therapeutische Anwendung genomeditierter Gehirnzellen und daraus gezüchteter Gehirn-Organoide wirft auch ethische und rechtliche Fragen auf. Ein Team um Hans-Georg Dederer, Lehrstuhlinhaber für Staats-, Völker- und Internationales Wirtschaftsrecht an der Universität Passau, versucht Antworten zu finden.
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20.08.2019
Was darf die Wissenschaft, was darf die Medizin?
Passauer Forscher erarbeiten Rechtsrahmen für Forschung und Therapien mit genomeditierten Gehirnzellen.
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07.05.2019
Mini-Gehirn in der Petrischale
Neuer Bayerischer Forschungsverbund ForInter untersucht erstmals das Zusammenspiel verschiedener Gehirnzellen mit Hilfe einer dreidimensionalen lebendigen Gewebestruktur in der Petrischale.
Veröffentlichungen
-
Publikationen
In preparation
Flegel, N.*, Furlanetto, F.*, Alfonsetti, M., Bohl, B., Turan, S., Lie, D.C., Kuhlmann, T., Winkler, J., Falk, S.*, Wegner, M.*, Karow, M.* (2023) Establishment of a novel human organoid model system reveals requirement of TCF4 for oligodendroglial differentiation. In preparation
Käseberg S* Bertin M*, Menon R*, Gabassi E*, Todorov H*, Frank S, Brennenstuhl H, Lohrer B, Winter J, Krummeich J, Winkler J, Winner B, Weis E, Hartwich D, Diederich S, Luck K, Gerber S, Lunt P, Berninger B, Falk S*, Schweiger S*, Karow M*. Dynamic X-chromosomal reactivation enhances female brain resilience. BioRxiv 2023.06.17.545424 (Manuscript in revision in Cell).
Nikolova, M. T., Catellani, A., Hinke, J., Okamoto, R., Lin, H.-C., Kaindl, J., He, Z., Geirsdottir, L., Camp, J. G., Amit, I., Winner, B., Treutlein, B. Single-cell transcriptomic landscape of stem cell-derived microglia and their co-culture with neural organoids. (in preparation, current version shared)
Wihan J, Battis K, Hoffmann A, Himmler M, Schubert DW, Xiang W, Kuhlmann T, Winkler J (2023) Alpha synuclein–mediated cytoskeletal dysfunction impairs myelinogenesis in human oligodendrocytes. Nature communications. (submitted)
Zhisong, Dony, Fleck, Szałata, X. Li,Slišković, Lin, Santel, Sun, Organoid Biological Network, J. Gray Camp, Fabian J. Theis, Barbara Treutlein. An integrated transcriptomic cell atlas of human neural organoids. (in preparation, current version shared)
Zoppi F, Lohrer B, Kruse K, Kinfe T, Schichor C, Imayoshi I, Berninger B, Karow M*, Falk S*. Counteracting cellular safeguarding mechanisms during direct lineage reprogramming into human induced neurons. (2023) (Manuscript in preparation).
Since 2024
Kremp, M., Aberle, T., Sock, E., Bohl, B., Hillgärtner, S., Winkler, J., & Wegner, M. (2024). Transcription factor Olig2 is a major downstream effector of histone demethylase Phf8 during oligodendroglial development. Glia, 10.1002/glia.24538. Advance online publication. https://doi.org/10.1002/glia.24538
Frank, S., Gabassi, E., Käseberg, S., Bertin, M., Zografidou, L., Pfeiffer, D., Brennenstuhl, H., Falk, S., Karow, M., & Schweiger, S. (2024). Absence of the RING domain in MID1 results in patterning defects in the developing human brain. Life science alliance, 7(4), e202302288. https://doi.org/10.26508/lsa.202302288
Krumm, L., Pozner, T., Zagha, N., Coras, R., Arnold, P., Tsaktanis, T., Scherpelz, K., Davis, M. Y., Kaindl, J., Stolzer, I., Süß, P., Khundadze, M., Hübner, C. A., Riemenschneider, M. J., Baets, J., Günther, C., Jayadev, S., Rothhammer, V., Krach, F., Winkler, J., Winner, B., … Regensburger, M. (2024). Neuroinflammatory disease signatures in SPG11-related hereditary spastic paraplegia patients. Acta neuropathologica, 147(1), 28. https://doi.org/10.1007/s00401-023-02675-w
2023
Akdas, E. Y., Turan, S., Guhathakurta, D., Ekici, A., Salar, S., Lie, D. C., Winner, B., & Fejtova, A. (2023). CRISPR/Cas9-mediated generation of hESC lines with homozygote and heterozygote p.R331W mutation in CTBP1 to model HADDTS syndrome. Stem Cell Res, 67, 103012. https://doi.org/10.1016/j.scr.2022.103012
Asadollahi, R., Delvendahl, I., Muff, R., Tan, G., Rodríguez, D. G., Turan, S., Russo, M., Oneda, B., Joset, P., Boonsawat, P., Masood, R., Mocera, M., Ivanovski, I., Baumer, A., Bachmann-Gagescu, R., Schlapbach, R., Rehrauer, H., Steindl, K., Begemann, A., Reis, A., Winkler, J., Winner, B., Müller, M., & Rauch, A. (2023). Pathogenic SCN2A variants cause early-stage dysfunction in patient-derived neurons. Hum Mol Genet, 32(13), 2192-2204. https://doi.org/10.1093/hmg/ddad048
Battis, K., Xiang, W., & Winkler, J. (2023). The Bidirectional Interplay of α-Synuclein with Lipids in the Central Nervous System and Its Implications for the Pathogenesis of Parkinson's Disease. Int J Mol Sci, 24(17). https://doi.org/10.3390/ijms241713270
Braun, F. K., Rothhammer-Hampl, T., Lorenz, J., Pohl, S., Menevse, A. N., Vollmann-Zwerenz, A., Bumes, E., Büttner, M., Zoubaa, S., Proescholdt, M., Schmidt, N. O., Hau, P., Beckhove, P., Winner, B., & Riemenschneider, M. J. (2023). Scaffold-Based (Matrigel™) 3D Culture Technique of Glioblastoma Recovers a Patient-like Immunosuppressive Phenotype. Cells, 12(14). https://doi.org/10.3390/cells12141856
Fischer, D. S., Schaar, A. C., & Theis, F. J. (2023). Modeling intercellular communication in tissues using spatial graphs of cells. Nat Biotechnol, 41(3), 332-336. https://doi.org/10.1038/s41587-022-01467-z
Fleck, J. S., Jansen, S. M. J., Wollny, D., Zenk, F., Seimiya, M., Jain, A., Okamoto, R., Santel, M., He, Z., Camp, J. G., & Treutlein, B. (2023). Inferring and perturbing cell fate regulomes in human brain organoids. Nature, 621(7978), 365-372. https://doi.org/10.1038/s41586-022-05279-8
Heumos, L., Schaar, A. C., Lance, C., Litinetskaya, A., Drost, F., Zappia, L., Lücken, M. D., Strobl, D. C., Henao, J., Curion, F., Schiller, H. B., & Theis, F. J. (2023). Best practices for single- cell analysis across modalities. Nat Rev Genet, 24(8), 550- 572. https://doi.org/10.1038/s41576023-00586-w
Krach, F., Boerstler, T., Reischl, S., Krumm, L., Regensburger, M., Winkler, J., Winner, B. (2023). RNA splicing modulator induces peripheral neuropathy with increased neurofilament light chain levels via p53 signaling. bioRxiv 2023.08.02.551640; doi: https://doi.org/10.1101/2023.08.02.551640
Marxreiter, F., Lambrecht, V., Mennecke, A., Hanspach, J., Jukic, J., Regensburger, M., Herrler, J., German, A., Kassubek, J., Grön, G., Müller, H. P., Laun, F. B., Dörfler, A., Winkler, J., & Schmidt, M. A. (2023). Parkinson's disease or multiple system atrophy: potential separation by quantitative susceptibility mapping. Ther Adv Neurol Disord, 16, 17562864221143834. https://doi.org/10.1177/17562864221143834
Masanetz, R. K., Baum, W., Schett, G., Winkler, J., & Süß, P. (2023). Cellular plasticity and myeloid inflammation in the adult brain are independent of the transcriptional modulator DREAM. Neurosci Lett, 796, 137061. https://doi.org/10.1016/j.neulet.2023.137061
Menon, R., Petrucci, L., Lohrer, B., Zhang, J., Schulze, M., Schichor, C., Winner, B., Winkler, J., Riemenschneider, M. J., Kühn, R., Falk, S., & Karow, M. (2023). Human Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Pericytes as Scalable and Editable Source to Study Direct Lineage Reprogramming Into Induced Neurons. Cell Reprogram. https://doi.org/10.1089/cell.2023.0008
Michielsen, L., Lotfollahi, M., Strobl D., Sikkema L., Reinders, M. J. T., Theis, F. J., Mahfouz, A. (2023). Single-cell reference mapping to construct and extend cell-type hierarchies. NAR Genomics and Bioinformatics, 5(3), lqad070. https://doi.org/10.1093/nargab/lqad070
Rich-Griffin, C., Curion, F., Thomas, T., Agarwal, D., Theis F. J., (2023) Dendrou, C. A., Panpipes: a pipeline for multiomic single-cell data analysis, bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2023.03.11.532085
Sikkema, L., Ramírez-Suástegui, C., Strobl, D. C.., M. D., Theis, F. J., & Lung Biological Network, C. (2023). An integrated cell atlas of the lung in health and disease. Nature Medicine, 29(6), 1563-1577. https://doi.org/10.1038/s41591-023-02327-2
2022
Battis, K., Florio, J. B., Mante, M., Lana, A., Naumann, I., Gauer, C., Lambrecht, V., Müller, S. J., Cobo, I., Fixsen, B., Kim, H. Y., Masliah, E., Glass, C. K., Schlachetzki, J. C. M., Rissman, R. A., Winkler, J., & Hoffmann, A. (2022). CSF1R-Mediated Myeloid Cell Depletion Prolongs Lifespan But Aggravates Distinct Motor Symptoms in a Model of Multiple System Atrophy. J Neurosci, 42(40), 7673-7688. https://doi.org/10.1523/jneurosci.0417-22.2022
Dederer, H.-G., Hamburger, D. (2022). Are genome-edited micro-organisms covered by Directive 2009/41/EC?—implications of the CJEU’s judgment in the case C-528/16 for the contained use of genome-edited micro-organisms. Journal of Law and the Biosciences, 9 (2022), 1-27. https://doi.org/10.1093/jlb/lsab033
Gunther, C., Winner, B., Neurath, M. F., & Stappenbeck, T. S. (2022). Organoids in gastrointestinal diseases: from experimental models to clinical translation. Gut, 71(9), 1892-1908. https://doi.org/10.1136/gutjnl-2021-326560
Hrovatin, K., Bastidas-Ponce, A., Bakhti, M., Zappia, L., Büttner, M., Sallino, C., Sterr, M., Böttcher, A., Migliorini, A., Lickert, H., Theis, F. J. (2022) Delineating mouse β-cell identity during lifetime and in diabetes with a single cell atlas. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2022.12.22.521557
Karpf, J., Unichenko, P., Chalmers, N., Beyer, F., Wittmann, M. T., Schneider, J., Fidan, E., Reis, A., Beckervordersandforth, J., Brandner, S., Liebner, S., Falk, S., Sagner, A., Henneberger, C., & Beckervordersandforth, R. (2022). Dentate gyrus astrocytes exhibit layer-specific molecular, morphological and physiological features. Nat Neurosci, 25(12), 1626-1638. https://doi.org/10.1038/s41593-022-01192-5
Krach, F., Stemick, J., Boerstler, T., Weiss, A., Lingos, I., Reischl, S., Meixner, H., Ploetz, S., Farrell, M., Hehr, U., Kohl, Z., Winner, B., & Winkler, J. (2022). An alternative splicing modulator decreases mutant HTT and improves the molecular fingerprint in Huntington's disease patient neurons. Nat Commun, 13(1), 6797. https://doi.org/10.1038/s41467-022-34419-x
Krach, F., Wheeler, E. C., Regensburger, M., Boerstler, T., Wend, H., Vu, A. Q., Wang, R., Reischl, S., Boldt, K., Batra, R., Aigner, S., Ravits, J., Winkler, J., Yeo, G. W., & Winner, B. (2022). Aberrant NOVA1 function disrupts alternative splicing in early stages of amyotrophic lateral sclerosis. Acta Neuropathol, 144(3), 413-435. https://doi.org/10.1007/s00401-022-02450-3
Lanfer, J., Kaindl, J., Krumm, L., Gonzalez Acera, M., Neurath, M., Regensburger, M., Krach, F., & Winner, B. (2022). Efficient and Easy Conversion of Human iPSCs into Functional Induced Microglia-like Cells. Int J Mol Sci, 23(9). https://doi.org/10.3390/ijms23094526
Luecken, M. D., Buttner, M., Chaichoompu, K., Danese, A., Interlandi, M., Mueller, M. F., Strobl, D. C., Zappia, L., Dugas, M., Colome-Tatche, M., & Theis, F. J. (2022). Benchmarking atlas-level data integration in single-cell genomics. Nat Methods, 19(1), 41-50. https://doi.org/10.1038/s41592-021-01336-8
Masanetz, R. K., Winkler, J., Winner, B., Günther, C., & Süß, P. (2022). The Gut-Immune-Brain Axis: An Important Route for Neuropsychiatric Morbidity in Inflammatory Bowel Disease. Int J Mol Sci, 23(19). https://doi.org/10.3390/ijms231911111
Palla, G., Spitzer, H., Klein, M., Fischer, D., Schaar, A. C., Kuemmerle, L. B., Rybakov, S., Ibarra, I. L., Holmberg, O., Virshup, I., Lotfollahi, M., Richter, S., & Theis, F. J. (2022). Squidpy: a scalable framework for spatial omics analysis. Nature Methods, 19(2), 171-178. https://doi.org/10.1038/s41592-021-01358-2
Pieger, K., Schmitt, V., Gauer, C., Giessl, N., Prots, I., Winner, B., Winkler, J., Brandstatter, J. H., & Xiang, W. (2022). Translocation of Distinct Alpha Synuclein Species from the Nucleus to Neuronal Processes during Neuronal Differentiation. Biomolecules, 12(8). https://doi.org/10.3390/biom12081108
Prieto Huarcaya, S., Drobny, A., Marques, A. R. A., Di Spiezio, A., Dobert, J. P., Balta, D., Werner, C., Rizo, T., Gallwitz, L., Bub, S., Stojkovska, I., Belur, N. R., Fogh, J., Mazzulli, J. R., Xiang, W., Fulzele, A., Dejung, M., Sauer, M., Winner, B., Rose-John, S., Arnold, P., Saftig, P., & Zunke, F. (2022). Recombinant pro-CTSD (cathepsin D) enhances SNCA/α-Synuclein degradation in α-Synucleinopathy models. Autophagy, 18(5), 1127-1151. https://doi.org/10.1080/15548627.2022.2045534
Rizo, T., Gebhardt, L., Riedlberger, J., Eberhardt, E., Fester, L., Alansary, D., Winkler, J., Turan, S., Arnold, P., Niemeyer, B. A., Fischer, M. J. M., & Winner, B. (2022). Store-operated calcium entry is reduced in spastin-linked hereditary spastic paraplegia. Brain, 145(9), 3131-3146. https://doi.org/10.1093/brain/awac122
Schmidt, S., Luecken, M. D., Trümbach, D., Hembach, S., Niedermeier, K. M., Wenck, N., Pflügler, K., Stautner, C., Böttcher, A., Lickert, H., Ramirez-Suastegui, C., Ahmad, R., Ziller, M. J., Fitzgerald, J. C., Ruf, V., van de Berg, W. D. J., Jonker, A. J., Gasser, T., Winner, B., Winkler, J., Vogt Weisenhorn, D. M., Giesert, F., Theis, F. J., & Wurst, W. (2022). Primary cilia and SHH signaling impairments in human and mouse models of Parkinson's disease. Nat Commun, 13(1), 4819. https://doi.org/10.1038/s41467-022-32229-9
Schneider, Y., Turan, S., Koller, A., Krumbiegel, M., Farrell, M., Plötz, S., Winkler, J., & Xiang, W. (2022). Generation of a homozygous and a heterozygous SNCA gene knockout human-induced pluripotent stem cell line by CRISPR/Cas9 mediated allele-specific tuning of SNCA expression. Stem Cell Res, 65, 102952. https://doi.org/10.1016/j.scr.2022.102952
Seebauer, L., Schneider, Y., Drobny, A., Plotz, S., Koudelka, T., Tholey, A., Prots, I., Winner, B., Zunke, F., Winkler, J., & Xiang, W. (2022). Interaction of Alpha Synuclein and Microtubule Organization Is Linked to Impaired Neuritic Integrity in Parkinson's Patient-Derived Neuronal Cells. Int J Mol Sci, 23(3). https://doi.org/10.3390/ijms23031812
Stern, S., Lau, S., Manole, A., Rosh, I., Percia, M. M., Ben Ezer, R., Shokhirev, M. N., Qiu, F., Schafer, S., Mansour, A. A., Mangan, K. P., Stern, T., Ofer, P., Stern, Y., Diniz Mendes, A. P., Djamus, J., Moore, L. R., Nayak, R., Laufer, S. H., Aicher, A., Rhee, A., Wong, T. L., Nguyen, T., Linker, S. B., Winner, B., Freitas, B. C., Jones, E., Sagi, I., Bardy, C., Brice, A., Winkler, J., Marchetto, M. C., & Gage, F. H. (2022). Reduced synaptic activity and dysregulated extracellular matrix pathways in midbrain neurons from Parkinson's disease patients. NPJ Parkinsons Dis, 8(1), 103. https://doi.org/10.1038/s41531-022-00366-z
Triebelhorn, J., Cardon, I., Kuffner, K., Bader, S., Jahner, T., Meindl, K., Rothhammer-Hampl, T., Riemenschneider, M. J., Drexler, K., Berneburg, M., Nothdurfter, C., Manook, A., Brochhausen, C., Baghai, T. C., Hilbert, S., Rupprecht, R., Milenkovic, V. M., & Wetzel, C. H. (2022). Induced neural progenitor cells and iPS-neurons from major depressive disorder patients show altered bioenergetics and electrophysiological properties. Mol Psychiatry. https://doi.org/10.1038/s41380-022-01660-1
van den Hurk, M., Lau, S., Marchetto, M. C., Mertens, J., Stern, S., Corti, O., Brice, A., Winner, B., Winkler, J., Gage, F. H., & Bardy, C. (2022). Druggable transcriptomic pathways revealed in Parkinson's patient-derived midbrain neurons. NPJ Parkinsons Dis, 8(1), 134. https://doi.org/10.1038/s41531-022-00400-0
Wolff, H. (2022). Patentierbarkeit von aus iPSZ hergestellten Gehirnorganoiden. GRUR, 124 (2022). 1473-1481.
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2021
Büttner, M., Ostner, J., Müller, C. L., Theis, F. J., & Schubert, B. (2021). scCODA is a Bayesian model for compositional single-cell data analysis. Nature Communications, 12(1), 6876. https://doi.org/10.1038/s41467-021-27150-6
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Guner, F., Pozner, T., Krach, F., Prots, I., Loskarn, S., Schlotzer-Schrehardt, U., Winkler, J., Winner, B., & Regensburger, M. (2021). Axon-Specific Mitochondrial Pathology in SPG11 Alpha Motor Neurons. Front Neurosci, 15, 680572. https://doi.org/10.3389/fnins.2021.680572
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Rothhammer-Hampl, T., Liesenberg, F., Hansen, N., Hoja, S., Delic, S., Reifenberger, G., & Riemenschneider, M. J. (2021). Frequent Epigenetic Inactivation of DIRAS-1 and DIRAS-2 Contributes to Chemo-Resistance in Gliomas. Cancers (Basel), 13(20). https://doi.org/10.3390/cancers13205113
Wittmann, M.T., Katada, S., Sock, E., Kirchner, P., Ekici, A.B., Wegner, M., Nakashima, K., Lie, D.C. & Reis, A. (2021). scRNA sequencing uncovers a TCF4-dependent transcription factor network regulating commissure development in mouse. Development Jul 15;148(14):dev196022. doi: 10.1242/dev.196022
Wolff, H., Kunz, A. (2021). Hirnorganoide – Ethische Herausforderungen und ihre Berücksichtigung und Umsetzung im Recht). MedR, 39 (2021), 800-808. https://doi.org/10.1007/s00350-021-5977-9
Zappia, L., & Theis, F. J. (2021). Over 1000 tools reveal trends in the single-cell RNA-seq analysis landscape. Genome Biol, 22(1), 301. https://doi.org/10.1186/s13059-021-02519-4
Zunke, F., Winner, B., Richter, F., & Caraveo, G. (2021). Editorial: Intracellular Mechanisms of α-Synuclein Processing. Front Cell Dev Biol, 9, 752378. https://doi.org/10.3389/fcell.2021.752378
2020
Boerstler, T., Wend, H., Krumbiegel, M., Kavyanifar, A., Reis, A., Lie, D. C., Winner, B., & Turan, S. (2020). CRISPR/Cas9 mediated generation of human ARID1B heterozygous knockout hESC lines to model Coffin-Siris syndrome. Stem Cell Res, 47, 101889. https://doi.org/10.3389/fcell.2021.752378
Krach, F., Bogiongko, M. E., & Winner, B. (2020). Decoding Parkinson's disease - iPSC-derived models in the OMICs era. Mol Cell Neurosci, 106, 103501. https://doi.org/10.1016/j.mcn.2020.103501
Kunz, A., Wolff, H. (2020). Hirnorganoide – Ethische Herausforderungen und ihre Berücksichtigung und Umsetzung im Recht).
Lambrecht, V., Hanspach, J., Hoffmann, A., Seyler, L., Mennecke, A., Straub, S., Marxreiter, F., Bäuerle, T., Laun, F. B., & Winkler, J. (2020). Quantitative susceptibility mapping depicts severe myelin deficit and iron deposition in a transgenic model of multiple system atrophy. Exp Neurol, 329, 113314. https://doi.org/10.1016/j.expneurol.2020.113314
Lampert, A., Bennett, D. L., McDermott, L. A., Neureiter, A., Eberhardt, E., Winner, B., & Zenke, M. (2020). Human sensory neurons derived from pluripotent stem cells for disease modelling and personalized medicine. Neurobiol Pain, 8, 100055. https://doi.org/10.1016/j.ynpai.2020.100055
Lorenz, J., Rothhammer-Hampl, T., Zoubaa, S., Bumes, E., Pukrop, T., Kolbl, O., Corbacioglu, S., Schmidt, N. O., Proescholdt, M., Hau, P., & Riemenschneider, M. J. (2020). A comprehensive DNA panel next generation sequencing approach supporting diagnostics and therapy prediction in neurooncology. Acta Neuropathol Commun, 8(1), 124. https://doi.org/10.1186/s40478-020-01000-w
Pecikiewicz, J., Wolff, H. (2020). Enhancement mit Gehirnorganoiden – Ethische und Rechtliche Probleme einer terra incognita
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Regensburger, M., Stemick, J., Masliah, E., Kohl, Z., & Winner, B. (2020). Intracellular A53T Mutant α-Synuclein Impairs Adult Hippocampal Newborn Neuron Integration. Front Cell Dev Biol, 8, 561963. https://doi.org/10.3389/fcell.2020.561963
Simmnacher K, Krach F, Schneider Y, Alecu JE, Mautner L, Klein P, Roybon L, Prots I, Xiang W, Winner B. (2020) Unique signatures of stress-induced senescent human astrocytes. Exp Neurol.; 334:113466. doi: https://doi.org/10.3389/fncel.2019.00571
Stemick, J., Gauer, C., Wihan, J., Moceri, S., Xiang, W., von Hörsten, S., Kohl, Z., & Winkler, J. (2020). Compensatory neuritogenesis of serotonergic afferents within the striatum of a transgenic rat model of Parkinson's disease. Brain Res, 1748, 147119. https://doi.org/10.1016/j.brainres.2020.147119
Wedel, M., Fröb, F., Elsesser, O., Wittmann, M. T., Lie, D. C., Reis, A., & Wegner, M. (2020). Transcription factor Tcf4 is the preferred heterodimerization partner for Olig2 in oligodendrocytes and required for differentiation. Nucleic Acids Res, 48(9), 4839-4857. https://doi.org/10.1093/nar/gkaa218
2019
Alieva, M., Leidgens, V., Riemenschneider, M. J., Klein, C. A., Hau, P., & van Rheenen, J. (2019). Intravital imaging of glioma border morphology reveals distinctive cellular dynamics and contribution to tumor cell invasion. Sci Rep, 9(1), 2054. https://doi.org/10.1038/s41598-019-38625-4
Kaindl, J., & Winner, B. (2019). Disease Modeling of Neuropsychiatric Brain Disorders Using Human Stem Cell-Based Neural Models. Current topics in behavioral neurosciences, 42, 159–183. https://doi.org/10.1007/7854_2019_111
Maroni, M., Korner, J., Schuttler, J., Winner, B., Lampert, A., & Eberhardt, E. (2019). beta1 and beta3 subunits amplify mechanosensitivity of the cardiac voltage-gated sodium channel Nav1.5. Pflugers Arch, 471(11-12), 1481-1492. https://doi.org/10.1007/s00424-019-02324-w
Simmnacher, K., Lanfer, J., Rizo, T., Kaindl, J., & Winner, B. (2019). Modeling Cell-Cell Interactions in Parkinson's Disease Using Human Stem Cell-Based Models. Front Cell Neurosci, 13, 571. https://doi.org/10.3389/fncel.2019.00571
Turan, S., Boerstler, T., Kavyanifar, A., Loskarn, S., Reis, A., Winner, B., & Lie, D. C. (2019). A novel human stem cell model for Coffin-Siris syndrome-like syndrome reveals the importance of SOX11 dosage for neuronal differentiation and survival. Hum Mol Genet, 28(15), 2589-2599. https://doi.org/10.1093/hmg/ddz089
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Veranstaltungen
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24.09.2024
Forschende ergreifen das Mikrofon – Seien Sie dabei bei unserem Science Slam in Erlangen!
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25.04.2024
Gelungener Girls’ Day mit ForInter
Wir freuen uns über den gelungenen Girls’ Day, an dem 21 Schülerinnen einen Tag lang in die Welt der Forschung eintauchen durften.
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22.03.2024
Einblick in die Welt der Forschung: Oberstufenschülerinnen und -schüler besuchen uns
ForInter öffnet für Oberstufenschülerinnen und -schüler am UniStemDay die Türen.
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14.03.2024
ForInter bietet Girls Day Teilnahme an
ForInter nimmt auch am Girls Day teil und bietet spannende Einblicke aus verschiedenen Perspektiven, darunter als Bioinformatikerin, Professorin oder Geschäftsführerin.
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14.03.2024
ForInter ist wieder dabei und bietet Oberstufenschüler*innen Einblicke in die Forschungswelt
ForInter ist zum dritten Mal in Folge dabei und öffnet die Türen zum UniStem Day 24, um den Schülerinnen und Schülern einen Einblick in die Forschungsräume zu gewähren.
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09.01.2024
Internationales Symposium zum Abschluss der Forschungsarbeiten von ForInter
Der Forschungsverbund ForInter, der über einen Zeitraum von 4 Jahren mit einer Finanzierung von über 4 Millionen Euro durch das Bayerische Staatsministerium für Wissenschaft und Kunst gefördert wurde, beendete seine Forschungsarbeiten erfolgreich im Jahr 2023. Dieses bedeutende Kapitel endete mit einem internationalen Symposium "Interaktion humaner Gehirnzellen" in der Carl-Friedrich von Siemensstiftung in München, bei dem angesehene Experten wie Prof. Dr. Dr. Fabian Theis, Prof. Dr. Barbara Treutlein, Prof. Dr. Ludo Van Den Bosch und Prof. Dr. Simon Schäfer wegweisende Erkenntnisse der Zell-Zell Interaktionen präsentierten. Weitere Informationen über den Forschungsverbund ForInter finden Sie unter www.forinter.de oder hier. Die Vorträge können Sie in YouTube ansehen.
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15.06.2023
Verbundmeeting in Passau
Der Forschungsverbund triftt sich diesemal in Passau an der Universität Passau und bespricht zum alljährlichen Verbundtreffen die Ergebnisse des Forschungsverbundes.
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28.10.2022
Gehirnorganoide in Forschung und Therapie - Buchveröffentlichung im Springer Verlag
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13.10.2022
Bulk-RNA Sequenzierungs Workshop für DoktorandInnen
Das ForInter-Doktorandenprogramm organisierte in Zusammenarbeit mit der Core Unit Bioinformatik, Datenintegration und -Analyse (CUBIDA) am Uniklinikum Erlangen einen zweitägigen Workshop zur Bulk-RNA Sequenzierungsdatenanalyse. Dieser Workshop fand in Erlangen statt und ermöglichte den Teilnehmenden, ihre Fähigkeiten und Expertise in der Analyse von Bulk-RNA-Sequenzierungsdaten zu erweitern und zu verbessern.
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27.07.2022
Verbundmeeting in Regensburg
Der Forschungsverbund triftt sich diesemal in Regensburg am Universitätsklinikum Regensburg und bespricht zum alljährlichen Verbundtreffen die Ergebnisse des Forschungsverbundes.
Mehr Infos in der Agenda
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18.11.2021
Verbundmeeting in Waischenfeld - erstmals wieder in Person
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16.10.2021
Science Lates - das "künstliche" Gehirn der Stammzellforschung
Science Slam und Podiumsdiskussion mit ForInter
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16.10.2021
Hi!A – Festival für Kunst & Forschung in Bayern
Das vom Bayerischen Staatsministerium für Wissenschaft und Kunst initiierte Hi!A-Festival soll Lust darauf machen, Kreativität als Motor für künstlerische und technische Innovationen im Freistaat zu entdecken. Es bietet u. a. Panels, Podcasts, Ausstellungen, Workshops, Performances, Werkstattgespräche, Science Slams, Konzerte und mehr – und das alles analog, hybrid und digital. Neben Erlangen gibt es viele weitere Spielorte in ganz Bayern, u. a. auch in Nürnberg, Regensburg und Würzburg.
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05.03.2021
ForInter@UniStem Day 21 - Virtuelle Veranstaltung zum Thema Mini-Brains
ForInter organisiert einen virtuellen Projekttag für Oberstufenschüler*innen
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Spannende Vorträge, Diskussionen, Live-Schaltungen ins Labor und Meet the Expert Runde sollen Einblicke in die Organoid- und Stammzellenforschung geben.
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09.12.2020
Internationale Symposium - 25-26. Februar 2021 - Brain Organoids in Research and Therapy – Emerging Ethical and Legal Issues
Die Funktion des menschlichen Gehirns ist immer noch ein Rätsel. Bis vor kurzem stand nur Obduktionsgewebe für eine strukturelle Untersuchung des Gehirns zur Verfügung. Folglich konnten die Untersuchungsergebnisse nur den Zustand am Lebensende widerspiegeln. Um die Entwicklung und Funktion des Gehirns besser zu verstehen, sind jedoch dynamische und funktionelle Untersuchungen verschiedener menschlicher Gehirnzellen erforderlich.
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27.11.2020
TaskForce und Verbundtreffen im November 2020 - erfolgreich virtuell mit 40 Verbundmitgliedern
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18.07.2020
Verbundtreffen im Juli - diesmal virtuell
Am 18. Juni traf sich der ForInter Verbund zum dritten Verbundtreffen. Aufgrund der aktuellen Einschränkungen durch Corona fand dieses Verbundtreffen nicht wie geplant in Erlangen statt, stattdessen tagten wir erstmalig virtuell. Thematisieren wurden unter anderem die Projektfortschritte und die Zielsetzung zur Erfüllung der weiteren Milestones.
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30.06.2020
Scanpy Workshop
Die Technologie der Einzelzell RNA Sequenzierung eröffnete ein neues Kapitel in der Erforschung der Biologie von einzelnen Zellen. Die Untersuchung des Transkriptoms von Tausenden von Zellen erforderte aber auch neue Software "Werkzeuge". Dr. Maren Büttner, Postdoktorandin in Theis Gruppe und Forschungsmitlied in ForInter konzipierte ein zweitägiges Workshop in Form eines Webinars für die Wissenschaftler*innen von ForInter zum Thema Datenanalyse von Einzelzellen mit Scanpy.
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20.02.2020
Let's talk about Science
Am 20.02.2020, 19.00 Uhr, fand im Stylight in München ein Abend unter dem Motto „Let’s talk about Science" statt. Zusammen mit „15x4-Munich“ gaben ForInter Wissenschaftler und Wissenschaftlerinnen einem Publikum von interessierten Laien einen Einblick in ihre Forschungsarbeiten. Die Vortragenden Prof. Beate Winner, Dr. Maren Büttner, Hannes Wolff und Johanna Kaindl präsentierten jeweils in einem 15-minütigen Vortrag dem Publikum interessante Aspekte ihrer Arbeit und gingen auf weiterführende Fragen und Gespräche in entspannter Atmosphäre bei Getränken und Fingerfood ein.
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27.01.2020
Erster Python-Programmierkurs für ForInter Forscher*innen in Erlangen
Dieser Kurs fokussiert auf die wissenschaftliche Programmierung mit Python.
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02.12.2019
Interesse an Scanpy: Einladung nach San Francisco für die Gruppe von Fabian Theis
Die Python-basierte Software Scanpy, die von der Arbeitsgruppe von Fabian Theis entwickelt wurde, erregt die Aufmerksamkeit von CZ Biohub.
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19.10.2019
Lange Nacht der Wissenschaften 2019
Willkommen bei der Langen Nacht der Wissenschaften in Erlangen!
Der Bayerische Forschungsverbund ForInter ist mit einem Informationsstand und einem Vortrag vertreten und freut sich auf interessierte Besucher.
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14.10.2019
ForInter Seminar
14. - 15. 10. 2019
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Abtei Frauenwörth, Frauenchiemsee -
02.05.2019
Kick-off Meeting ForInter
Erlangen
Mehr Information zum Kick-off Meeting finden Sie hier in der Agenda
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Kontakt
Naime Zagha
Geschäftsführung ForInter
Universitätsklinikum Erlangen
Universitätsstraße 22
91054 Erlangen
E-mail: naime.denguir@uk-erlangen.de
Tel: +49 (0)9131 85-39359
Mobil: +49 (0)172 3239104