FOR-COVID

Bayerischer Forschungsverbund zur Eindämmung, Behandlung und Erforschung der Erkrankung mit dem neuartigen Coronavirus COVID-19 (FOR-COVID)

Molekulare Entschlüsselung der Interaktionen des SARS-CoV-2 RNA Genoms mit der Wirtszelle.

Arbeitsfeld:

Erforschung der Virus-Zell Interaktion: Pathogeneseforschung und Erforschung neuer Therapieansätze

 

Projektleiter
Prof. Dr. Jörg Vogel
Dr. Mathias Munschauer

Für die Entwicklung effektiver Therapien gegen COVID-19 ist die Entschlüsselung der molekularen Vorgänge in einer infizierten humanen Zelle von grundlegender Bedeutung. In der ersten Förderperiode konnten wir mehr als 100 humane Proteine identifizieren, welche direkt mit dem RNA Genom von SARS-CoV-2 interagieren und die Vermehrung des Virus beeinflussen. In der zweiten Förderperiode möchten wir  den Wirkmechanismus eines neu entdeckten antiviralen Proteins untersuchen, um eine potenzielle therapeutische Anwendung zu ermöglichen. Weiterhin werden wir gezielt nach Schwachstellen des Virus suchen. Hierbei konzentrieren wir uns auf ein zentrales Produkt der Virusreplikation: doppelsträngige RNA. Diese kann von einer Vielzahl an Rezeptoren des Immunsystems detektiert werden, welche umgehend gezielte Abwehrmechanismen aktivieren. Die regulatorische Bedeutung dieser so entdeckten Sensor- bzw. RNA-Bindeproteine im Infektionskontext werden wir mit neusten Methoden der Einzelzellsequenzierung beschreiben. Mit Hilfe der gewonnen Daten schaffen wir die Grundlage, um Schwachpunkte des Virus therapeutisch nutzbar zu machen.

 

Projektpartner:

  • The SARS-CoV-2 RNA–protein interactome in infected human cells.

    Nora Schmidt, Caleb A Lareau, Hasmik Keshishian, Sabina Ganskih, Cornelius Schneider, Thomas Hennig, Randy Melanson, Simone Werner, Yuanjie Wei, Matthias Zimmer, Jens Ade, Luisa Kirschner, Sebastian Zielinski, Lars Dölken, Eric S Lander, Neva Caliskan, Utz Fischer, Jörg Vogel, Steven A Carr, Jochen Bodem, Mathias Munschauer

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    Nat Microbiol 2021, 6(3):339-353. PMID: 33349665
    https://www.nature.com/articles/s41564-020-00846-z

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  • SND1 binds SARS-CoV-2 negative-sense RNA and promotes viral RNA synthesis through NSP9

    Nora Schmidt, Sabina Ganskih, Yuanjie Wei, Alexander Gabel, Sebastian Zielinski, Hasmik Keshishian, Caleb A Lareau, Liv Zimmermann, Jana Makroczyova, Cadence Pearce, Karsten Krey, Thomas Hennig, Sebastian Stegmaier, Lambert Moyon, Marc Horlacher, Simone Werner, Jens Aydin, Marco Olguin-Nava, Ramya Potabattula, Anuja Kibe, Lars Dölken, Redmond P Smyth, Neva Caliskan, Annalisa Marsico, Christine Krempl, Jochen Bodem, Andreas Pichlmair, Steven A Carr, Petr Chlanda, Florian Erhard, Mathias Munschauer

    Full Text

    Cell. 2023 Sep 28:S0092-8674(23)00980-7.

    doi: 10.1016/j.cell.2023.09.002.

    https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.09.002

     

     

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  • Protective immune trajectories in early viral containment of non-pneumonic SARS-CoV-2 infection

    Kami Pekayvaz, Alexander Leunig, Rainer Kaiser, Markus Joppich, Sophia Brambs, Aleksandar Janjic, Oliver Popp, Daniel Nixdorf, Valeria Fumagalli, Nora Schmidt, Vivien Polewka, Afra Anjum, Viktoria Knottenberg, Luke Eivers, Lucas E. Wange, Christoph Gold, Marieluise Kirchner, Maximilian Muenchhoff, Johannes C. Hellmuth, Clemens Scherer, Raquel Rubio-Acero, Tabea Eser, Flora Deák, Kerstin Puchinger, Niklas Kuhl, Andreas Linder, Kathrin Saar, Lukas Tomas, Christian Schulz, Andreas Wieser, Wolfgang Enard, Inge Kroidl, Christof Geldmacher, Michael von Bergwelt-Baildon, Oliver T. Keppler, Mathias Munschauer, Matteo Iannacone, Ralf Zimmer, Philipp Mertins, Norbert Hubner, Michael Hoelscher, Steffen Massberg, Konstantin Stark, and Leo Nicolai

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    Nature Communications 2022 Feb 23;13(1):1018. PMID: 35197461

    https://doi.org/10.1038/s41467-022-28508-0

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  • SHIFTR enables the unbiased identification of proteins bound to specific RNA regions in live cells

    Jens Aydin, Alexander Gabel, Sebastian Zielinski , Sabina Ganskih, Nora Schmidt, Christina R. Hartigan, Monica Schenone, Steven A. Carr, Mathias Munschauer

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    Nucleic Acids Res. 2024, 52(5):e26. PMID: 38281241

    https://doi.org/10.1093/nar/gkae038

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Informationen

Gründungsdatum

10.2020

Ende

12.2024

Gefördert durch

Bayerisches Staatsministerium für Wissenschaft und Kunst